L'huile essentielle de clou de girofle contient en moyenne 23 composés : - des sesquiterpènes : alpha et bêta caryophyllènes (de 7 à 10%), alpha et bêta humulènes, alpha amorphène, alpha muurolène, calaménène, calacorène. - des esters : hexanoates d'éthyle, acétates de 2-heptanyle, de 2-nonalyle, de styralyle, de benzyle, d'eugénol (de 4 à 10%), de terpényle et d'éthylphényle; - des phénols : eugénol (75 à 85%), cis et trans isoeugénol, chavicol, 4-allylphénol. - des oxydes : oxyde de caryophyllène, époxyde d'humulène L'eugénol, un des composants majeur de l'huile essentielle explique l'action antiseptiques et
anesthésique du clou de girofle. L'eygnénol fait parti des phénols. Les phénols est une molécule composée d'une unité d'hydroxyde se rattachant à un anneau d'atomes de carbone. Dans les huiles essentielles, les phénols sont plus fortes que l'alcools. La propriété antiseptique peut elle s'expliquer par son action sur la membrane cellulaire. Donc avant de pouvoir comprendre l'action antiseptique de l'eugénol, il faut étudier la perméabilité de la membrane cellulaire.

Les cellules sont donc entourées des glycérophospholipides qui s'organisent en double couche, isolant l'intérieur de la cellule du milieu extérieur :
La membrane sert donc de barrière relativement imperméable au passage de la plupart des molécules hydrosolubles. C'est le caractère hydrophobe de la partie interne de la double couche lipidique qui est en fait une barrière extrêmement imperméable à la plupart des molécules polaires.

Mais les doubles couches lipidiques sont extrêmement imperméables à toutes molécules chargées (ions), quelle que soit la taille.
L'eugénol va entraîner une perte de la perméabilité sélective de la membrane par changement
de ses propriétés physiques. Cette dénaturation des protéines membranaires par l'eugénol est due à la coexistence d'une partie hydrophile et d'une partie lipophile. A une concentration importante, il dénature les protéines. C'est l'effet létal. Lorsque la concentration est plus faible, il inactive les systémes enzymatiques et altérent la membrane cytoplasmique.
Molécule d'éugenol